Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 CASC1 Gene 0 1.64 0.84 1.41 1.21 0.69 0.68 0.34 2 395990 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 389246 Transcript 0 0.92 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 395987 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 5 320267 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 6 395992 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 354189 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1a ExonRegion 0 1.71 0.42 0.10 2.04 0.33 0.00 0.00 9 E1_Ab KnownBoundary 0 3.71 0.00 0.00 2.90 1.11 0.00 0.00 10 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 1.63 2.13 0.00 0.00 1.07 0.00 11 E1a_E6a KnownJunction 0 0.92 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER1b ExonRegion 0 3.07 2.54 1.51 1.98 0.81 0.50 0.12 13 ER1c ExonRegion 0 0.71 2.20 2.48 2.08 0.00 2.37 0.26 14 E1b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER2a ExonRegion 0 1.24 0.07 0.04 0.07 0.00 0.00 0.00 17 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E3a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER6a ExonRegion 0 0.92 1.17 1.05 0.00 0.03 0.00 0.00 24 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 1.63 3.28 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER7a ExonRegion 0 3.63 0.49 3.08 1.03 0.25 0.00 0.44 26 E7a_E8a KnownJunction 0 3.39 0.00 0.65 0.00 1.18 0.00 0.67 27 ER8a ExonRegion 0 2.90 0.00 2.72 0.93 1.80 0.00 0.24 28 E8a_E9a KnownJunction 0 2.07 0.00 3.45 0.00 0.00 0.00 0.73 29 ER9a ExonRegion 0 2.32 0.00 3.04 0.00 0.86 0.32 0.27 30 E9a_E10a KnownJunction 0 3.91 0.00 3.87 0.00 2.07 1.66 0.00 31 ER10a ExonRegion 0 1.67 0.00 2.65 0.37 2.02 0.73 0.00 32 E10a_E11a KnownJunction 0 4.89 0.00 0.78 1.68 4.59 1.61 0.00 33 ER11a ExonRegion 0 3.67 0.00 1.41 0.79 0.78 2.86 0.00 34 E11a_E12a KnownJunction 0 1.59 0.00 3.05 1.68 0.00 1.21 0.00 35 ER12a ExonRegion 0 3.63 0.98 1.00 1.07 1.30 1.84 0.89 36 E12a_E13a KnownJunction 0 2.75 1.44 0.00 0.00 0.88 0.00 1.48 37 ER13a ExonRegion 0 0.86 1.61 0.21 0.74 0.62 0.00 0.36 38 E13a_E14a KnownJunction 0 1.03 1.52 0.75 1.68 0.00 0.00 0.00 39 ER14a ExonRegion 0 0.54 0.53 1.00 1.41 0.26 0.00 0.32 40 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 1.63 0.89 2.55 0.00 0.00 0.00 41 ER15a ExonRegion 0 1.66 1.94 1.52 2.36 0.53 0.00 0.00 42 E15a_E16a KnownJunction 0 0.77 3.07 0.00 1.08 0.00 0.00 0.00 43 ER16a ExonRegion 0 2.38 1.01 2.84 0.74 0.38 0.10 0.24 44 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 1.26 3.55 1.68 0.00 1.29 0.00 45 ER17a ExonRegion 0 1.28 0.43 1.21 2.78 0.74 0.69 0.61 46 E17a_E18a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.56 4.47 0.00 1.66 0.00 47 ER18a ExonRegion 0 0.35 0.66 0.41 2.54 1.32 0.43 0.84 48 E18a_E19a KnownJunction 0 0.88 3.05 0.68 3.85 1.18 0.00 0.59 49 E18a_E19b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 ER19a ExonRegion 0 0.66 3.16 0.85 1.11 1.29 0.00 0.11 51 E19_Ab KnownBoundary 0 1.03 0.97 0.63 1.33 1.18 0.00 0.00 52 ER19b ExonRegion 0 0.27 0.82 0.28 1.31 0.41 0.55 0.45 53 E19_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.78 0.00 0.00 0.00 0.00 54 ER19c ExonRegion 0 0.49 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 55 ER20a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00