Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	GSG1	Gene	0	0.18	0.23	0.21	0.20	3.60	0.39	0.34
2	351606	Transcript	0	0.00	1.16	0.46	0.00	0.65	0.00	0.00
3	324458	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	337630	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	405543	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	396302	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0
7	396310	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER1a	ExonRegion	0	0.00	1.16	0.46	0.00	0.65	0.00	0.00
9	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	2.60	0.83	1.30	1.18	0.00	0.00
10	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.76	1.04	0.53	0.31	0.00	0.00
11	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER2b	ExonRegion	0	0.22	0.00	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00
14	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00
15	ER3a	ExonRegion	0	0.12	0.00	0.10	0.00	0.48	0.59	0.00
16	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E3a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47
19	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85
20	ER5a	ExonRegion	0	0.02	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	0.39
21	E5_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	0.66
22	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E5a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER5b	ExonRegion	0	0.94	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	0.65
25	E5b_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89
26	I5	Intron	0	0.34	0.00	0.61	0.00	7.66	0.27	0.08
27	I5_SR2	SilentIntronRegion	0	0.34	0.00	0.31	0.00	10.75	0.82	0.00
28	ER6a	ExonRegion	0	0.76	0.00	0.00	0.00	12.26	0.00	0.14
29	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.11	0.00	0.00
30	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.82	0.92	0.00	7.85	0.00	0.46
31	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	9.31	0.00	0.00
32	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.04	9.08	0.00	0.00
33	E8_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	5.26	0.00	0.00
34	E8a_E8b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	E8_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	1.60	7.33	0.00	0.00
36	ER8b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.25	6.85	0.00	0.00
37	ER8c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.25	8.33	0.00	0.18
38	E8_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	1.30	2.28	0.00	0.62
39	ER8d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.79	0.00	1.23
40	ER8e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	10.59	0.00	1.35
41	ER8f	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.62	6.15	0.61	0.77
42	E8_Dd	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.34	0.00	0.00
43	ER8g	ExonRegion	0	0.00	0.90	0.00	0.00	5.45	0.53	0.04
44	E8_De	KnownBoundary	0	0.00	1.29	0.00	0.00	2.97	1.66	0.00
45	ER8h	ExonRegion	0	0.15	0.46	0.21	0.00	4.76	0.21	0.95
46	E8_Df	KnownBoundary	0	1.00	0.00	0.00	0.00	4.01	0.00	0.89
47	ER8i	ExonRegion	0	0.17	0.20	0.22	0.40	2.96	1.19	0.38