1	2975731	3355185	21	36160097	37386965	RUNX1-PRDM16	0	-	-	21	1
1	6835383	7829766	3	149235021	149464501	WWTR1-CAMTA1	0	-	-	3	1
1	11856206	11903201	7	140419126	140634564	CLCN6-BRAF	0	+	+	1	7
1	18947499	19075360	13	41129803	41250734	PAX7-FOXO1	0	+	+	1	13
1	35641978	35668749	9	133579332	133763062	SFPQ-ABL1	0	-	-	1	9
1	35641978	35668749	X	48886241	48911012	SFPQ-TFE3	0	-	+	1	X
1	36680016	36770958	17	5009732	5078329	THRAP3-USP6	0	+	-	1	17
1	37958175	37990375	6	33368175	33384230	MEAF6-PHF1	0	-	-	1	6
1	44574521	44600812	16	31181430	31203127	FUS-KLF17	0	-	+	16	1
1	44574521	44600812	22	29653997	29696515	EWSR1-KLF17	0	-	+	22	1
1	47681961	47707892	1	47715810	47789819	STIL-TAL1	0	+	-	1	1
1	51819934	51995000	11	118297204	118397539	KMT2A-EPS15	0	+	+	11	1
1	56960418	57120974	12	66207910	66360075	HMGA2-PPAP2B	0	+	+	12	1
1	92145901	92381892	10	103544199	103588696	TGFBR3-MGEA5	0	-	+	1	10
1	92145901	92381892	8	57073462	57133883	TGFBR3-PLAG1	0	-	+	1	8
1	101175297	101204601	1	110442863	110473614	CSF1-VCAM1	0	-	+	1	1
1	110442863	110473614	16	68761127	68869451	CSF1-CDH1	0	+	-	1	16
1	110442863	110473614	2	238232645	238333018	CSF1-COL6A3	0	+	+	1	2
1	110442863	110473614	2	216225162	216310895	CSF1-FN1	0	+	+	1	2
1	110517307	110566357	10	123237847	123367972	FGFR2-AHCYL1	0	-	-	10	1
1	110871127	110889299	2	95681421	95719737	RBM15-MAL	0	+	-	1	2
1	114935398	115063781	10	43562474	43625799	TRIM33-RET	0	-	-	1	10
1	147003181	147098017	1	156433518	156480620	MEF2D-BCL9	0	-	-	1	1
1	151020233	151040970	11	118297204	118397539	KMT2A-MLLT11	0	-	+	11	1
1	154127783	154177124	2	29415639	30154432	TPM3-ALK	0	-	+	1	2
1	154127783	154177124	1	156775431	156851642	TPM3-NTRK1	0	-	-	1	1
1	154127783	154177124	6	117609462	117757018	TPM3-ROS1	0	-	+	1	6
1	156042363	156109880	1	156775431	156851642	LMNA-NTRK1	0	+	-	1	1
1	156433518	156480620	5	149432853	149502935	MEF2D-CSF1R	0	-	+	1	5
1	156601181	156629324	1	156775431	156851642	BCAN-NTRK1	0	+	-	1	1
1	156710401	156770607	X	48886241	48911012	PRCC-TFE3	0	+	+	1	X
1	156775431	156851642	5	149781199	149802492	CD74-NTRK1	0	-	-	5	1
1	156775431	156851642	1	234740014	234755271	IRF2BP2-NTRK1	0	-	-	1	1
1	156775431	156851642	1	204787778	204991950	NFASC-NTRK1	0	-	+	1	1
1	156775431	156851642	1	186280783	186354825	TPR-NTRK1	0	-	-	1	1
1	156775431	156851642	5	179223387	179265078	SQSTM1-NTRK1	0	-	+	5	1
1	156775431	156851642	3	100418204	100467810	TFG-NTRK1	0	-	+	3	1
1	156775431	156851642	17	16935858	17120993	MPRIP-NTRK1	0	-	+	17	1
1	162029563	162353321	9	87273465	87638505	NOS1AP-NTRK2	0	+	-	1	9
1	164514820	164868533	19	1609290	1662604	TCF3-PBX1	0	-	-	19	1
1	164514820	164868533	22	29653997	29696515	EWSR1-PBX1	0	-	+	22	1
1	167589329	167675486	9	133579332	133763062	RCSD1-ABL1	0	+	-	1	9
1	169064934	169101960	8	31486901	32622548	ATP1B1-NRG1	0	+	-	1	8
1	179068461	179208819	12	11792787	12048336	ETV6-ABL2	0	+	+	12	1
1	186280783	186354825	2	29415639	30154432	TPR-ALK	0	-	+	1	2
1	186280783	186354825	7	116302443	116438440	TPR-MET	0	-	-	1	7
1	205626978	205659587	7	140419126	140634564	SLC45A3-BRAF	0	-	+	1	7
1	205626978	205659587	21	39751948	40043704	SLC45A3-ERG	0	-	+	1	21
1	205626978	205659587	7	13930852	14041050	SLC45A3-ETV1	0	-	+	1	7
1	205626978	205659587	3	185764096	185838107	SLC45A3-ETV5	0	-	+	1	3
1	234740014	234755271	5	149536357	149564120	IRF2BP2-CDX1	0	-	-	1	5
2	24704782	24993571	6	43129036	43149243	SRF-NCOA1	0	-	+	6	2
2	24704782	24993571	2	223064606	223173715	PAX3-NCOA1	0	-	-	2	2
2	29415639	30154432	4	83739813	83832319	SEC31A-ALK	0	+	-	4	2
2	29415639	30154432	19	16167830	16213813	TPM4-ALK	0	+	+	19	2
2	29415639	30154432	2	37070782	37203615	STRN-ALK	0	+	-	2	2
2	29415639	30154432	9	123664670	123701451	TRAF1-ALK	0	+	-	9	2
2	29415639	30154432	2	216166539	216214487	ATIC-ALK	0	+	+	2	2
2	29415639	30154432	5	179223387	179265078	SQSTM1-ALK	0	+	+	5	2
2	29415639	30154432	10	32297937	32355359	KIF5B-ALK	0	+	-	10	2
2	29415639	30154432	12	27666363	27848497	PPFIBP1-ALK	0	+	+	12	2
2	29415639	30154432	11	3022151	3088843	CARS-ALK	0	+	-	11	2
2	29415639	30154432	2	42386489	42559688	EML4-ALK	0	+	+	2	2
2	29415639	30154432	17	57687218	57773671	CLTC-ALK	0	+	+	17	2
2	29415639	30154432	2	218664511	218877718	TNS1-ALK	0	+	-	2	2
2	29415639	30154432	2	74109440	74146992	ACTG2-ALK	0	+	+	2	2
2	29415639	30154432	X	64798256	64961791	MSN-ALK	0	+	+	X	2
2	29415639	30154432	2	216225162	216310895	FN1-ALK	0	+	-	2	2
2	29415639	30154432	2	109325936	109402267	RANBP2-ALK	0	+	+	2	2
2	29415639	30154432	10	75747871	75879918	VCL-ALK	0	+	+	10	2
2	29415639	30154432	5	170804119	170838141	NPM1-ALK	0	+	+	5	2
2	29415639	30154432	7	75162620	75378280	HIP1-ALK	0	+	-	7	2
2	29415639	30154432	3	100418204	100467810	TFG-ALK	0	+	+	3	2
2	29415639	30154432	2	74588280	74629214	DCTN1-ALK	0	+	-	2	2
2	29415639	30154432	14	104018232	104167888	KLC1-ALK	0	+	+	14	2
2	37070782	37203615	9	87273465	87638505	STRN-NTRK2	0	-	-	2	9
2	37070782	37203615	4	55085263	55164414	STRN-PDGFRA	0	-	-	2	4
2	42386489	42559688	15	88418229	88809999	EML4-NTRK3	0	+	+	2	15
2	43393799	43833185	7	23349827	23520086	THADA-IGF2BP3	0	-	+	2	7
2	47562296	47614740	2	47620107	47789450	EPCAM-MSH2	0	+	-	2	2
2	54673421	54896812	5	149493399	149545435	SPTBN1-PDGFRB	0	+	+	2	5
2	89880567	90274235	12	4372937	4414516	IGK-CCND2	0	+	-	2	12
2	89880567	90274235	8	128737679	128753674	IGK-MYC	0	+	-	2	8
2	89880567	90274235	8	128753673	129263674	IGK-MYC	0	+	+	2	8
2	89890567	90284235	12	4372937	4414516	IGK-CCND2	0	-	-	2	12
2	89890567	90284235	8	128737679	128753674	IGK-MYC	0	-	-	2	8
2	89890567	90284235	8	128753673	129263674	IGK-MYC	0	-	+	2	8
2	100162322	100769201	11	118297204	118397539	KMT2A-AFF3	0	+	+	11	2
2	113973573	114046527	9	3824126	4358392	PAX8-GLIS3	0	-	+	2	9
2	113973573	114046527	22	46536423	46639653	PAX8-PPARA	0	-	-	2	22
2	113973573	114046527	3	12318866	12475855	PAX8-PPARG	0	-	-	2	3
2	174771186	174840430	22	29653997	29696515	EWSR1-SP3	0	+	+	22	2
2	176947618	176960666	11	3692312	3829022	NUP98-HOXD13	0	-	-	11	2
2	189829045	189877472	8	57073462	57133883	COL3A1-PLAG1	0	+	+	2	8
2	203640689	203746708	6	43129036	43149243	SRF-ICA1L	0	+	+	6	2
2	204561197	204603635	2	204722508	204738683	CTLA4-CD28	0	-	+	2	2
2	208384460	208468155	22	29653997	29696515	EWSR1-CREB1	0	-	+	22	2
2	216225162	216310895	8	38268655	38336352	FN1-FGFR1	0	-	+	2	8
2	219845808	219860379	16	31181430	31203127	FUS-FEV	0	+	+	16	2
2	219845808	219860379	22	29653997	29696515	EWSR1-FEV	0	+	+	22	2
2	223064606	223173715	13	41129803	41250734	PAX3-FOXO1	0	-	+	2	13
2	223064606	223173715	4	140637906	141085338	PAX3-MAML3	0	-	+	2	4
2	223064606	223173715	8	71021996	71326040	PAX3-NCOA2	0	-	+	2	8
2	223715651	223809357	7	13930852	14041050	ACSL3-ETV1	0	+	+	2	7
2	237466429	237491001	12	66207910	66360075	HMGA2-ACKR3	0	-	+	12	2
2	242244514	242293442	11	118297204	118397539	KMT2A-SEPT2	0	-	+	11	2
3	9022274	9414737	3	12625099	12715725	SRGAP3-RAF1	0	-	+	3	3
3	12625099	12715725	6	163825031	163999628	QKI-RAF1	0	+	+	6	3
3	41226327	41301587	8	57073462	57133883	CTNNB1-PLAG1	0	+	+	3	8
3	48701363	48733797	11	118297204	118397539	KMT2A-NCKIPSD	0	+	+	11	3
3	71003843	71643140	9	133579332	133763062	FOXP1-ABL1	0	-	-	3	9
3	100418204	100467810	9	102574136	102629173	TFG-NR4A3	0	+	-	3	9
3	100418204	100467810	6	117609462	117757018	TFG-ROS1	0	+	+	3	6
3	108268715	108318491	11	118297204	118397539	KMT2A-KIAA1524	0	+	+	11	3
3	128338816	128409918	3	168801286	169391406	RPN1-MECOM	0	-	+	3	3
3	158278951	158325041	5	170804119	170838141	NPM1-MLF1	0	-	+	5	3
3	168801286	169391406	21	36160097	37386965	RUNX1-MECOM	0	+	-	21	3
3	176737142	176925261	3	189339204	189615068	TBL1XR1-TP63	0	-	-	3	3
3	185764096	185838107	21	42836477	42913043	TMPRSS2-ETV5	0	+	-	21	3
3	187439164	187473515	14	106022613	107288051	IGH-BCL6	0	+	+	14	3
3	187439164	187473515	22	22370473	23265085	IGL-BCL6	0	+	+	22	3
3	187439164	187473515	14	106032613	107298051	IGH-BCL6	0	+	-	14	3
3	187439164	187473515	22	22380473	23275085	IGL-BCL6	0	+	-	22	3
3	187861071	188608460	12	66207910	66360075	HMGA2-LPP	0	-	+	12	3
4	1713226	1746898	4	1785033	1810599	FGFR3-TACC3	0	-	+	4	4
4	1785033	1810599	7	97920962	98040380	FGFR3-BAIAP2L1	0	+	+	4	7
4	1785033	1810599	4	6027925	6212318	FGFR3-JAKMIP1	0	+	+	4	4
4	1785033	1810599	14	106022613	107288051	IGH-FGFR3	0	-	+	14	4
4	1785033	1810599	14	106032613	107298051	IGH-FGFR3	0	-	-	14	4
4	1863150	1983934	14	106022613	107288051	IGH-WHSC1	0	-	+	14	4
4	1863150	1983934	14	106032613	107298051	IGH-WHSC1	0	-	-	14	4
4	25646922	25680370	6	117609462	117757018	SLC34A2-ROS1	0	+	+	4	6
4	44175925	44460824	9	87273465	87638505	KCTD8-NTRK2	0	-	-	4	9
4	54233809	55161439	4	55085263	55164414	FIP1L1-PDGFRA	0	+	-	4	4
4	55085263	55164414	9	123151146	123352448	CDK5RAP2-PDGFRA	0	-	-	9	4
4	55085263	55164414	4	55944643	56001756	KDR-PDGFRA	0	-	-	4	4
4	55085263	55164414	12	11792787	12048336	ETV6-PDGFRA	0	-	+	12	4
4	55085263	55164414	10	32297937	32355359	KIF5B-PDGFRA	0	-	-	10	4
4	55085263	55164414	22	23511890	23660224	BCR-PDGFRA	0	-	+	22	4
4	55085263	55164414	10	93548068	93625033	TNKS2-PDGFRA	0	-	+	10	4
4	82009836	82146218	5	149493399	149545435	PRKG2-PDGFRB	0	-	+	4	5
4	83739813	83832319	9	4975032	5128183	SEC31A-JAK2	0	-	-	4	9
4	87846153	88062206	11	118297204	118397539	KMT2A-AFF1	0	-	+	11	4
4	99172534	99365012	11	3692312	3829022	NUP98-RAP1GDS1	0	-	-	11	4
4	108511432	108651608	7	140419126	140634564	PAPSS1-BRAF	0	-	+	4	7
4	140637906	141085338	X	39909067	40046582	BCOR-MAML3	0	+	-	X	4
4	190995266	191007077	19	42762688	42799949	CIC-DUX4	0	-	+	19	4
4	190995266	191007077	14	106022613	107288051	IGH-DUX4	0	-	+	14	4
4	190995266	191007077	14	106032613	107298051	IGH-DUX4	0	-	-	14	4
5	294290	438406	8	71021996	71326040	AHRR-NCOA2	0	+	+	5	8
5	1253261	1305184	17	7200317	7215774	EIF5A-TERT	0	+	+	17	5
5	38475064	38618456	8	57073462	57133883	LIFR-PLAG1	0	-	+	5	8
5	76315075	76361059	5	149493399	149545435	AGGF1-PDGFRB	0	+	+	5	5
5	80708839	81057616	9	4975032	5128183	SSBP2-JAK2	0	-	-	5	9
5	122100690	122165803	9	133579332	133763062	SNX2-ABL1	0	+	-	5	9
5	131142682	131357936	12	11792787	12048336	ETV6-ACSL6	0	+	+	12	5
5	132211070	132309326	11	118297204	118397539	KMT2A-AFF4	0	+	+	11	5
5	142139948	142608576	11	118297204	118397539	KMT2A-ARHGAP26	0	-	+	11	5
5	149493399	149545435	15	43699406	43812926	TP53BP1-PDGFRB	0	+	-	15	5
5	149493399	149545435	9	460290	746105	KANK1-PDGFRB	0	+	+	9	5
5	149493399	149545435	20	18558536	18744561	DTD1-PDGFRB	0	+	+	20	5
5	149493399	149545435	12	11792787	12048336	ETV6-PDGFRB	0	+	+	12	5
5	149493399	149545435	12	14508609	14651697	ATF7IP-PDGFRB	0	+	+	12	5
5	149493399	149545435	12	110367606	110444194	GIT2-PDGFRB	0	+	-	12	5
5	149493399	149545435	14	91737666	91894188	CCDC88C-PDGFRB	0	+	-	14	5
5	149493399	149545435	5	158122927	158536769	EBF1-PDGFRB	0	+	-	5	5
5	149493399	149545435	7	75162620	75378280	HIP1-PDGFRB	0	+	-	7	5
5	149493399	149545435	17	5175557	5289129	RABEP1-PDGFRB	0	+	+	17	5
5	149493399	149545435	6	118781934	119041238	CEP85L-PDGFRB	0	+	-	6	5
5	149781199	149802492	8	31486901	32622548	CD74-NRG1	0	-	-	5	8
5	149781199	149802492	6	117609462	117757018	CD74-ROS1	0	-	+	5	6
5	156559943	156682201	9	93554068	93660831	ITK-SYK	0	+	-	5	9
5	158122927	158536769	12	66207910	66360075	HMGA2-EBF1	0	+	+	12	5
5	170726287	170739138	14	99635623	99747861	TLX3-BCL11B	0	+	+	5	14
5	170804119	170838141	17	38455443	38513094	NPM1-RARA	0	+	-	5	17
5	176550025	176727216	11	3692312	3829022	NUP98-NSD1	0	-	-	11	5
5	179338650	179509118	7	140419126	140634564	RNF130-BRAF	0	-	+	5	7
6	7097829	7252213	16	14155177	14360630	RREB1-MKL2	0	+	-	6	16
6	18224098	18275054	9	133990947	134110057	DEK-NUP214	0	-	-	6	9
6	31132118	31158508	22	29653997	29696515	EWSR1-POU5F1	0	+	+	22	6
6	33368175	33384230	10	32556678	32677726	EPC1-PHF1	0	-	-	10	6
6	33368175	33384230	7	27870191	28230362	JAZF1-PHF1	0	-	-	7	6
6	33368175	33384230	12	132424507	132565005	EP400-PHF1	0	-	+	12	6
6	41651715	41713997	22	29653997	29696515	EWSR1-TFEB	0	+	+	22	6
6	41651715	41713997	17	57687218	57773671	CLTC-TFEB	0	+	+	17	6
6	41651715	41713997	11	65255232	65273940	MALAT1-TFEB	0	+	+	11	6
6	41651715	41713997	7	5566781	5613415	ACTB-TFEB	0	+	-	7	6
6	43129036	43149243	20	32263488	32284210	SRF-E2F1	0	+	+	6	20
6	43129036	43149243	13	41129803	41250734	SRF-FOXO1	0	+	+	6	13
6	43129036	43149243	8	71021996	71326040	SRF-NCOA2	0	+	+	6	8
6	43129036	43149243	11	65421066	65440565	SRF-RELA	0	+	+	6	11
6	108871037	109005977	11	118297204	118397539	KMT2A-FOXO3	0	-	+	11	6
6	117576720	117594728	6	139693392	139705757	VGLL2-CITED2	0	+	+	6	6
6	117576720	117594728	8	71021996	71326040	VGLL2-NCOA2	0	+	+	6	8
6	117609462	117757018	12	50569570	50687329	LIMA1-ROS1	0	+	-	12	6
6	117609462	117757018	20	43953927	43987064	SDC4-ROS1	0	+	-	20	6
6	117609462	117757018	7	6485583	6533873	KDELR2-ROS1	0	+	-	7	6
6	117609462	117757018	10	61548520	61676414	CCDC6-ROS1	0	+	-	10	6
6	117609462	117757018	6	117639373	117933691	GOPC-ROS1	0	+	-	6	6
6	117609462	117757018	6	118781934	119041238	CEP85L-ROS1	0	+	-	6	6
6	117609462	117757018	X	64798256	64961791	MSN-ROS1	0	+	+	X	6
6	117609462	117757018	12	59265930	59324303	LRIG3-ROS1	0	+	-	12	6
6	117609462	117757018	6	159186772	159250444	EZR-ROS1	0	+	-	6	6
6	117609462	117757018	17	1247565	1313672	YWHAE-ROS1	0	+	-	17	6
6	127429748	127518910	6	128289923	128851870	PTPRK-RSPO3	0	-	-	6	6
6	135492452	135540311	9	14081841	14408982	MYB-NFIB	0	+	+	6	9
6	163825031	163999628	9	87273465	87638505	QKI-NTRK2	0	+	-	6	9
6	167402669	167466201	8	38268655	38336352	FGFR1OP-FGFR1	0	+	+	6	8
6	168217601	168372703	11	118297204	118397539	KMT2A-MLLT4	0	-	+	11	6
7	5346420	5475045	11	118297204	118397539	KMT2A-TNRC18	0	+	+	11	7
7	5566781	5613415	12	57843917	57866045	ACTB-GLI1	0	-	-	7	12
7	6134514	6201195	21	36160097	37386965	RUNX1-USP42	0	-	-	21	7
7	13930852	14041050	14	38023251	38048330	RP11-356O9.1-ETV1	0	+	+	14	7
7	13930852	14041050	7	26229546	26251149	HNRNPA2B1-ETV1	0	+	-	7	7
7	13930852	14041050	19	51354823	51383823	KLK2-ETV1	0	+	+	19	7
7	13930852	14041050	21	42836477	42913043	TMPRSS2-ETV1	0	+	-	21	7
7	13930852	14041050	7	16831434	16883057	AGR2-ETV1	0	+	-	7	7
7	13930852	14041050	22	29653997	29696515	EWSR1-ETV1	0	+	+	22	7
7	27202053	27220117	11	3692312	3829022	NUP98-HOXA9	0	+	-	11	7
7	27233121	27249725	11	3692312	3829022	NUP98-HOXA13	0	+	-	11	7
7	27870191	28230362	17	30254036	30328064	JAZF1-SUZ12	0	-	-	7	17
7	55076713	55324313	15	40976971	41024354	EGFR-RAD51	0	+	-	7	15
7	55076713	55324313	7	55861236	55940482	EGFR-SEPT14	0	+	+	7	7
7	69053904	70258054	9	36833271	37044103	PAX5-AUTS2	0	-	-	9	7
7	73432118	73484237	9	36833271	37044103	PAX5-ELN	0	-	-	9	7
7	74061993	74175026	17	38455443	38513094	GTF2I-RARA	0	+	-	7	17
7	79753270	79848718	7	140419126	140634564	GNAI1-BRAF	0	+	+	7	7
7	91560180	91739987	7	140419126	140634564	AKAP9-BRAF	0	+	+	7	7
7	94013872	94060544	8	57073462	57133883	COL1A2-PLAG1	0	+	+	7	8
7	97481429	97511854	7	104644625	104754808	KMT2E-ASNS	0	+	+	7	7
7	100760369	100782547	19	45961252	45978437	SERPINE1-FOSB	0	+	-	7	19
7	101448958	101927249	7	140419126	140634564	CUX1-BRAF	0	+	+	7	7
7	101448958	101927249	8	38268655	38336352	CUX1-FGFR1	0	+	+	7	8
7	116302443	116438440	10	32297937	32355359	KIF5B-MET	0	-	-	10	7
7	116302443	116438440	7	121503142	121702090	PTPRZ1-MET	0	-	+	7	7
7	127282233	127732661	7	140419126	140634564	SND1-BRAF	0	+	+	7	7
7	129241554	129396922	7	140419126	140634564	NRF1-BRAF	0	+	+	7	7
7	137559724	137696813	16	31181430	31203127	FUS-CREB3L2	0	+	+	16	7
7	138135078	138274738	7	140419126	140634564	TRIM24-BRAF	0	+	+	7	7
7	138516125	138676064	7	140419126	140634564	KIAA1549-BRAF	0	-	+	7	7
7	140152839	140189369	7	140419126	140634564	MKRN1-BRAF	0	-	+	7	7
7	140419126	140634564	7	141240988	141355044	AGK-BRAF	0	+	+	7	7
7	140419126	140634564	7	148385005	148498128	CUL1-BRAF	0	+	+	7	7
7	140419126	140634564	7	143050492	143069863	FAM131B-BRAF	0	+	-	7	7
7	140419126	140634564	7	150772917	150841523	AGAP3-BRAF	0	+	+	7	7
7	156786744	156813345	12	11792787	12048336	MNX1-ETV6	0	-	-	7	12
8	17770348	17885478	9	4975032	5128183	PCM1-JAK2	0	+	-	8	9
8	30231943	30429778	15	88418229	88809999	RBPMS-NTRK3	0	+	+	8	15
8	31486901	32622548	11	62613517	62656352	SLC3A2-NRG1	0	-	+	11	8
8	38127214	38249790	15	34625515	34649938	WHSC1L1-NUTM1	0	-	-	8	15
8	38268655	38336352	9	123827140	123939888	CNTRL-FGFR1	0	+	+	9	8
8	38268655	38336352	12	27081315	27119583	FGFR1OP2-FGFR1	0	+	+	12	8
8	38268655	38336352	13	20522809	20665968	ZMYM2-FGFR1	0	+	+	13	8
8	38268655	38336352	22	23511890	23660224	BCR-FGFR1	0	+	+	22	8
8	38268655	38336352	8	57073462	57133883	FGFR1-PLAG1	0	-	+	8	8
8	38268655	38336352	8	38575703	38710546	FGFR1-TACC1	0	-	-	8	8
8	41786996	41919508	16	3775054	3940727	KAT6A-CREBBP	0	-	+	8	16
8	41786996	41919508	22	41477789	41576081	KAT6A-EP300	0	-	-	8	22
8	41786996	41919508	8	71021996	71326040	KAT6A-NCOA2	0	-	+	8	8
8	42742074	42885682	10	43562474	43625799	HOOK3-RET	0	+	-	8	10
8	54879111	54945089	8	57073462	57133883	TCEA1-PLAG1	0	-	+	8	8
8	56782371	56923940	12	11792787	12048336	ETV6-LYN	0	-	+	12	8
8	57073462	57133883	8	122624355	122663630	HAS2-PLAG1	0	+	-	8	8
8	57073462	57133883	8	57114244	57131357	CHCHD7-PLAG1	0	+	+	8	8
8	57073462	57133883	8	61419415	61536186	RAB2A-PLAG1	0	+	+	8	8
8	61581336	61779465	X	18181050	18249024	CHD7-BEND2	0	+	+	8	X
8	67474409	67536482	9	14081841	14408982	MYBL1-NFIB	0	-	+	8	9
8	71021996	71326040	11	12685968	12966298	TEAD1-NCOA2	0	+	+	11	8
8	71021996	71326040	8	80676244	80690098	HEY1-NCOA2	0	+	-	8	8
8	92967202	93125514	21	36160097	37386965	RUNX1-RUNX1T1	0	+	-	21	8
8	108911543	109105913	8	109213444	109457562	EIF3E-RSPO2	0	+	-	8	8
8	128737679	128753674	15	45793333	45878488	HMGN2P46-MYC	0	-	+	15	8
8	128737679	128753674	14	106022613	107288051	IGH-MYC	0	-	+	14	8
8	128737679	128753674	22	22370473	23265085	IGL-MYC	0	-	+	22	8
8	128737679	128753674	14	106032613	107298051	IGH-MYC	0	-	-	14	8
8	128737679	128753674	22	22380473	23275085	IGL-MYC	0	-	-	22	8
8	128753673	129263674	14	106022613	107288051	IGH-MYC	0	+	+	14	8
8	128753673	129263674	22	22370473	23265085	IGL-MYC	0	+	+	22	8
8	128753673	129263674	14	106032613	107298051	IGH-MYC	0	+	-	14	8
8	128753673	129263674	22	22380473	23275085	IGL-MYC	0	+	-	22	8
8	134249413	134324265	21	39751948	40043704	NDRG1-ERG	0	-	+	8	21
9	4975032	5128183	22	23511890	23660224	BCR-JAK2	0	-	+	22	9
9	4975032	5128183	14	31363004	31505607	STRN3-JAK2	0	-	-	14	9
9	4975032	5128183	12	11792787	12048336	ETV6-JAK2	0	-	+	12	9
9	4975032	5128183	12	14508609	14651697	ATF7IP-JAK2	0	-	+	12	9
9	4975032	5128183	9	36833271	37044103	PAX5-JAK2	0	-	-	9	9
9	14081841	14408982	12	66207910	66360075	HMGA2-NFIB	0	+	+	12	9
9	15464063	15521017	11	3692312	3829022	NUP98-PSIP1	0	+	-	11	9
9	20341662	20632542	11	118297204	118397539	KMT2A-MLLT3	0	+	+	11	9
9	36833271	37044103	12	11792787	12048336	PAX5-ETV6	0	-	-	9	12
9	36833271	37044103	15	74277013	74340153	PAX5-PML	0	-	-	9	15
9	87273465	87638505	22	23511890	23660224	BCR-NTRK2	0	-	+	22	9
9	95176526	95196743	17	5009732	5078329	OMD-USP6	0	-	-	9	17
9	102574136	102629173	17	34126458	34191619	TAF15-NR4A3	0	-	+	17	9
9	102574136	102629173	15	57200820	57591479	TCF12-NR4A3	0	-	+	15	9
9	102574136	102629173	22	29653997	29696515	EWSR1-NR4A3	0	-	+	22	9
9	107996902	108201452	17	64288753	64806861	SLC44A1-PRKCA	0	+	-	9	17
9	128499623	128729656	22	29653997	29696515	EWSR1-PBX3	0	-	+	22	9
9	131435702	131458679	9	133990947	134110057	SET-NUP214	0	+	-	9	9
9	133579332	133763062	22	23511890	23660224	BCR-ABL1	0	-	+	22	9
9	133579332	133763062	9	133990947	134110057	NUP214-ABL1	0	-	+	9	9
9	133579332	133763062	10	80818791	81076276	ZMIZ1-ABL1	0	-	+	10	9
9	133579332	133763062	12	11792787	12048336	ETV6-ABL1	0	-	+	12	9
9	133579332	133763062	14	100194029	100408397	EML1-ABL1	0	-	+	14	9
9	136895426	136943657	15	34625515	34649938	BRD3-NUTM1	0	-	-	9	15
10	21068901	21473116	11	118297204	118397539	KMT2A-NEBL	0	+	+	11	10
10	21813093	22032559	11	85668726	85790924	PICALM-MLLT10	0	-	-	11	10
10	21813093	22032559	11	118297204	118397539	KMT2A-MLLT10	0	-	+	11	10
10	27035521	27160016	11	118297204	118397539	KMT2A-ABI1	0	+	+	11	10
10	32297937	32355359	10	43562474	43625799	KIF5B-RET	0	-	-	10	10
10	35405718	35501886	22	29653997	29696515	EWSR1-CREM	0	-	+	22	10
10	43562474	43625799	10	51555107	51590734	NCOA4-RET	0	-	+	10	10
10	43562474	43625799	10	61548520	61676414	CCDC6-RET	0	-	-	10	10
10	43562474	43625799	12	1089674	1605099	ERC1-RET	0	-	+	12	10
10	43562474	43625799	17	66497920	66547460	PRKAR1A-RET	0	-	+	17	10
10	51539497	51562517	21	39751948	40043704	MSMB-ERG	0	+	+	10	21
10	60262899	60591195	10	123237847	123367972	FGFR2-BICC1	0	-	-	10	10
10	61548520	61676414	10	123237847	123367972	FGFR2-CCDC6	0	+	-	10	10
10	70310412	70454239	11	118297204	118397539	KMT2A-TET1	0	-	+	11	10
10	76575339	76792380	17	44107281	44312733	KAT6B-KANSL1	0	+	+	10	17
10	81452982	81474437	17	1247565	1313672	YWHAE-NUTM2B	0	-	-	17	10
10	88975204	88996665	17	1247565	1313672	YWHAE-NUTM2A	0	-	-	17	10
10	103544199	103588696	10	123237847	123367972	FGFR2-MGEA5	0	+	-	10	10
10	111746125	111895323	11	3692312	3829022	NUP98-ADD3	0	-	-	11	10
10	123237847	123367972	12	42622248	42853517	FGFR2-PPHLN1	0	-	-	10	12
10	123237847	123367972	10	123738688	124014060	FGFR2-TACC2	0	-	-	10	10
11	3692312	3829022	11	108525751	108811657	NUP98-DDX10	0	-	-	11	11
11	3692312	3829022	12	54356909	54371427	NUP98-HOXC11	0	-	-	11	12
11	3692312	3829022	12	389294	508620	NUP98-KDM5A	0	-	+	11	12
11	3692312	3829022	17	7138346	7153041	NUP98-PHF23	0	-	+	11	17
11	32409320	32467176	22	29653997	29696515	EWSR1-WT1	0	+	+	22	11
11	46289211	46342972	22	29653997	29696515	EWSR1-CREB3L1	0	-	+	22	11
11	46289211	46342972	16	31181430	31203127	FUS-CREB3L1	0	-	+	16	11
11	57510985	57529253	11	118297204	118397539	KMT2A-BTBD18	0	+	+	11	11
11	63527363	63546113	16	14155177	14360630	C11orf95-MKL2	0	-	-	11	16
11	63527363	63546113	11	65421066	65440565	C11orf95-RELA	0	-	+	11	11
11	69445854	69469242	14	106022613	107288051	IGH-CCND1	0	-	+	14	11
11	69445854	69469242	14	106032613	107298051	IGH-CCND1	0	-	-	14	11
11	85668726	85790924	11	118297204	118397539	KMT2A-PICALM	0	+	+	11	11
11	95709761	96086344	11	118297204	118397539	KMT2A-MAML2	0	+	+	11	11
11	95709761	96086344	15	91063156	91188577	CRTC3-MAML2	0	+	+	15	11
11	95709761	96086344	19	18784486	18893004	CRTC1-MAML2	0	+	+	19	11
11	101971191	102104154	11	126071308	126132881	YAP1-FAM118B	0	+	-	11	11
11	101971191	102104154	X	149519688	149682448	YAP1-MAMLD1	0	+	-	11	X
11	101971191	102104154	X	48886241	48911012	YAP1-TFE3	0	+	+	11	X
11	102178214	102210134	18	56328617	56417371	BIRC3-MALT1	0	+	-	11	18
11	113920314	114121398	17	38455443	38513094	ZBTB16-RARA	0	+	-	11	17
11	118297204	118397539	19	39128288	39222223	KMT2A-ACTN4	0	+	-	11	19
11	118297204	118397539	11	119066751	119178859	KMT2A-CBL	0	+	-	11	11
11	118297204	118397539	14	105321616	105363107	KMT2A-CEP170B	0	+	-	11	14
11	118297204	118397539	16	3775054	3940727	KMT2A-CREBBP	0	+	+	11	16
11	118297204	118397539	19	18553472	18642937	KMT2A-ELL	0	+	+	11	19
11	118297204	118397539	22	41477789	41576081	KMT2A-EP300	0	+	-	11	22
11	118297204	118397539	X	153576891	153613006	KMT2A-FLNA	0	+	+	11	X
11	118297204	118397539	X	70306046	70323385	KMT2A-FOXO4	0	+	-	11	X
11	118297204	118397539	17	9813925	10111868	KMT2A-GAS7	0	+	+	11	17
11	118297204	118397539	14	66964124	67648520	KMT2A-GPHN	0	+	-	11	14
11	118297204	118397539	17	37016111	37078023	KMT2A-LASP1	0	+	-	11	17
11	118297204	118397539	19	6212965	6289959	KMT2A-MLLT1	0	+	+	11	19
11	118297204	118397539	17	36851794	36886056	KMT2A-MLLT6	0	+	-	11	17
11	118297204	118397539	19	8585673	8652461	KMT2A-MYO1F	0	+	+	11	19
11	118297204	118397539	22	19691986	19712295	KMT2A-SEPT5	0	+	-	11	22
11	118297204	118397539	X	118749686	118837333	KMT2A-SEPT6	0	+	+	11	X
11	118297204	118397539	17	75266650	75496678	KMT2A-SEPT9	0	+	-	11	17
11	128546429	128683162	22	29653997	29696515	EWSR1-FLI1	0	-	+	22	11
12	4372937	4414516	14	106022613	107288051	IGH-CCND2	0	-	+	14	12
12	4372937	4414516	22	22370473	23265085	IGL-CCND2	0	-	+	22	12
12	4372937	4414516	14	106032613	107298051	IGH-CCND2	0	-	-	14	12
12	4372937	4414516	22	22380473	23275085	IGL-CCND2	0	-	-	22	12
12	6775642	6808738	22	41477789	41576081	EP300-ZNF384	0	+	+	22	12
12	6775642	6808738	17	34126458	34191619	TAF15-ZNF384	0	+	+	17	12
12	11792787	12048336	22	28144264	28207486	MN1-ETV6	0	-	-	22	12
12	11792787	12048336	13	28577410	28684729	ETV6-FLT3	0	+	+	12	13
12	11792787	12048336	15	88418229	88809999	ETV6-NTRK3	0	+	+	12	15
12	11792787	12048336	21	36160097	37386965	ETV6-RUNX1	0	+	+	12	21
12	25357722	25413870	22	21893735	21978323	UBE2L3-KRAS	0	+	+	22	12
12	51147492	51214905	22	29653997	29696515	EWSR1-ATF1	0	-	+	22	12
12	51147492	51214905	16	31181430	31203127	FUS-ATF1	0	-	+	16	12
12	51487445	51576926	22	29653997	29696515	EWSR1-TFCP2	0	+	+	22	12
12	51487445	51576926	16	31181430	31203127	FUS-TFCP2	0	+	+	16	12
12	57472676	57489259	12	57489190	57535922	NAB2-STAT6	0	+	+	12	12
12	57910370	57924300	16	31181430	31203127	FUS-DDIT3	0	+	+	16	12
12	57910370	57924300	22	29653997	29696515	EWSR1-DDIT3	0	+	+	22	12
12	65444405	65525346	12	66207910	66360075	HMGA2-WIF1	0	+	+	12	12
12	66207910	66360075	13	39917028	40187665	HMGA2-LHFP	0	+	+	12	13
12	66207910	66360075	18	42250137	42648475	HMGA2-SETBP1	0	+	-	12	18
13	52148643	52336171	19	10677137	10689735	CDKN2D-WDFY2	0	-	-	19	13
14	23586512	23598825	14	106022613	107288051	IGH-CEBPE	0	+	+	14	14
14	23586512	23598825	14	106032613	107298051	IGH-CEBPE	0	+	-	14	14
14	100694634	100749129	22	29653997	29696515	EWSR1-YY1	0	-	+	22	14
14	106022613	107288051	18	60790578	60997361	IGH-BCL2	0	+	+	14	18
14	106022613	107288051	19	45240961	45263301	IGH-BCL3	0	+	-	14	19
14	106022613	107288051	X	1314889	1341616	IGH-CRLF2	0	+	+	14	X
14	106022613	107288051	16	79619739	79644611	IGH-MAF	0	+	+	14	16
14	106022613	107288051	18	56328617	56417371	IGH-MALT1	0	+	-	14	18
14	106022613	107288051	18	60730578	60790579	IGH-BCL2	0	+	-	14	18
14	106032613	107298051	18	60790578	60997361	IGH-BCL2	0	-	+	14	18
14	106032613	107298051	19	45240961	45263301	IGH-BCL3	0	-	-	14	19
14	106032613	107298051	X	1314889	1341616	IGH-CRLF2	0	-	+	14	X
14	106032613	107298051	16	79619739	79644611	IGH-MAF	0	-	+	14	16
14	106032613	107298051	18	56328617	56417371	IGH-MALT1	0	-	-	14	18
14	106032613	107298051	18	60730578	60790579	IGH-BCL2	0	-	-	14	18
15	34625515	34649938	19	42762688	42799949	CIC-NUTM1	0	-	+	19	15
15	34625515	34649938	19	15347646	15453356	BRD4-NUTM1	0	-	-	19	15
15	52599479	52831247	15	88418229	88809999	MYO5A-NTRK3	0	-	+	15	15
15	74277013	74340153	19	8554939	8577996	PML-PRAM1	0	+	+	15	19
15	74277013	74340153	17	38455443	38513094	PML-RARA	0	+	-	15	17
16	4354761	4389598	16	88941265	89053612	CBFA2T3-GLIS2	0	-	-	16	16
16	15797028	15960890	16	67053018	67134961	CBFB-MYH11	0	+	+	16	16
16	19717777	19868907	17	1247565	1313672	YWHAE-IQCK	0	-	-	17	16
16	31181430	31203127	21	39751948	40043704	FUS-ERG	0	+	+	16	21
16	64977655	65170015	17	5009732	5078329	CDH11-USP6	0	-	-	16	17
16	88941265	89053612	21	36160097	37386965	RUNX1-CBFA2T3	0	+	-	21	16
17	5009732	5078329	17	48260649	48288993	COL1A1-USP6	0	-	-	17	17
17	5009732	5078329	22	36677326	36794063	MYH9-USP6	0	-	-	22	17
17	38455443	38513094	X	39909067	40046582	BCOR-RARA	0	-	-	X	17
17	38455443	38513094	17	40351185	40438725	STAT5B-RARA	0	-	-	17	17
17	41605211	41666988	21	42836477	42913043	TMPRSS2-ETV4	0	+	-	21	17
17	41605211	41666988	17	76987798	77015949	CANT1-ETV4	0	+	-	17	17
17	41605211	41666988	19	51354823	51383823	KLK2-ETV4	0	+	+	19	17
17	41605211	41666988	22	29653997	29696515	EWSR1-ETV4	0	+	+	22	17
17	48260649	48288993	22	39619363	39650756	COL1A1-PDGFB	0	-	+	17	22
17	49254785	49347524	X	51139766	51151687	MBTD1-CXorf67	0	-	-	17	X
17	53332372	53402426	19	1609290	1662604	TCF3-HLF	0	-	-	19	17
17	57687218	57773671	X	48886241	48911012	CLTC-TFE3	0	+	+	17	X
17	79924682	79975282	X	48886241	48911012	ASPSCR1-TFE3	0	+	+	17	X
18	23596577	23681181	X	48104751	48126879	SS18-SSX1	0	-	-	18	X
18	23596577	23681181	X	52725945	52746239	SS18-SSX2	0	-	+	18	X
18	23596577	23681181	X	48232862	48252785	SS18-SSX4	0	-	-	18	X
19	14202499	14238896	19	14625581	14650582	DNAJB1-PRKACA	0	+	-	19	19
19	39887452	39900052	19	45961252	45978437	ZFP36-FOSB	0	+	-	19	19
19	39887452	39900052	19	45961252	45978437	ZFP36-FOSB	0	+	-	19	19
19	42762688	42799949	X	70306046	70323385	CIC-FOXO4	0	+	-	19	X
19	56633967	56672262	22	29653997	29696515	EWSR1-ZNF444	0	-	+	22	19
20	50003493	50189370	22	29653997	29696515	EWSR1-NFATC2	0	+	+	22	20
20	60708821	60757540	X	48104751	48126879	SS18L1-SSX1	0	+	-	20	X
21	39751948	40043704	21	42836477	42913043	TMPRSS2-ERG	0	+	-	21	21
21	39751948	40043704	22	29653997	29696515	EWSR1-ERG	0	+	+	22	21
22	28144264	28207486	22	31721789	31752218	MN1-PATZ1	0	-	+	22	22
22	29653997	29696515	22	31721789	31752218	EWSR1-PATZ1	0	+	+	22	22
22	29653997	29696515	X	48104751	48126879	EWSR1-SSX1	0	+	-	22	X
22	41687525	41756151	X	39909067	40046582	ZC3H7B-BCOR	0	+	+	22	X
X	1314889	1341616	X	1581464	1666000	P2RY8-CRLF2	0	+	-	X	X
X	39909067	40046582	X	49957363	50094909	BCOR-CCNB3	0	-	-	X	X
X	46994267	47046212	X	48886241	48911012	RBM10-TFE3	0	+	+	X	X
X	48886241	48911012	X	70493041	70521018	NONO-TFE3	0	+	+	X	X