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 utils.c                                                  04-Feb-2011 03:34   28K  
 treedist.c                                               26-Nov-2010 07:48   16K  
 svm_utils.c                                              26-Nov-2010 07:48   12K  
 svm.o                                                    09-May-2011 07:40  366K  
 subopt.c                                                 06-Dec-2010 11:15   43K  
 stringdist.c                                             26-Nov-2010 07:48   11K  
 RNAstruct.c                                              26-Nov-2010 07:48   13K  
 ribo.c                                                   04-Feb-2011 03:34   53K  
 read_epars.c                                             26-Nov-2010 07:48   36K  
 PS_dot.c                                                 03-Dec-2010 07:52   39K  
 ProfileDist.c                                            26-Nov-2010 07:48  7.2K  
 ProfileAln.c                                             26-Nov-2010 07:48  7.3K  
 plex_functions.c                                         26-Nov-2010 07:48  8.8K  
 part_func_up.c                                           07-Mar-2011 06:01   47K  
 part_func_co.c                                           26-Nov-2010 07:48   31K  
 part_func.c                                              04-Feb-2011 03:34   43K  
 params.c                                                 26-Nov-2010 07:48   23K  
 naview.c                                                 26-Nov-2010 07:48   30K  
 model_sd.inc                                             26-Nov-2010 07:48   91K  
 model_avg.inc                                            26-Nov-2010 07:48   41K  
 mm.c                                                     26-Nov-2010 07:48  3.3K  
 MEA.c                                                    26-Nov-2010 07:48  5.2K  
 Makefile.in                                              26-Nov-2010 07:50   85K  
 Makefile.am                                              26-Nov-2010 07:48  1.1K  
 Makefile                                                 09-May-2011 06:45   72K  
 LPfold.c                                                 26-Nov-2010 07:48   31K  
 list.h                                                   26-Nov-2010 07:48  1.7K  
 list.c                                                   26-Nov-2010 07:48   10K  
 libRNA_a-utils.o                                         09-May-2011 07:40   58K  
 libRNA_a-treedist.o                                      09-May-2011 07:40   40K  
 libRNA_a-svm_utils.o                                     09-May-2011 07:40  162K  
 libRNA_a-subopt.o                                        09-May-2011 07:40  124K  
 libRNA_a-stringdist.o                                    09-May-2011 07:40   29K  
 libRNA_a-RNAstruct.o                                     09-May-2011 07:40   33K  
 libRNA_a-ribo.o                                          09-May-2011 07:40   61K  
 libRNA_a-read_epars.o                                    09-May-2011 07:40   88K  
 libRNA_a-PS_dot.o                                        09-May-2011 07:40   81K  
 libRNA_a-ProfileDist.o                                   09-May-2011 07:40   20K  
 libRNA_a-ProfileAln.o                                    09-May-2011 07:40   21K  
 libRNA_a-plex_functions.o                                09-May-2011 07:40   47K  
 libRNA_a-part_func_up.o                                  09-May-2011 07:40  117K  
 libRNA_a-part_func_co.o                                  09-May-2011 07:40  106K  
 libRNA_a-part_func.o                                     09-May-2011 07:40  179K  
 libRNA_a-params.o                                        09-May-2011 07:40   57K  
 libRNA_a-naview.o                                        09-May-2011 07:40   58K  
 libRNA_a-mm.o                                            09-May-2011 07:40   21K  
 libRNA_a-MEA.o                                           09-May-2011 07:40   16K  
 libRNA_a-LPfold.o                                        09-May-2011 07:40  119K  
 libRNA_a-list.o                                          09-May-2011 07:40   14K  
 libRNA_a-Lfold.o                                         09-May-2011 07:40  147K  
 libRNA_a-inverse.o                                       09-May-2011 07:40   41K  
 libRNA_a-fold_vars.o                                     09-May-2011 07:40   11K  
 libRNA_a-fold.o                                          09-May-2011 07:40  265K  
 libRNA_a-findpath.o                                      09-May-2011 07:40   35K  
 libRNA_a-energy_par.o                                    09-May-2011 07:40  411K  
 libRNA_a-duplex.o                                        09-May-2011 07:40   80K  
 libRNA_a-dist_vars.o                                     09-May-2011 07:40  2.5K  
 libRNA_a-convert_epars.o                                 09-May-2011 07:40  468K  
 libRNA_a-cofold.o                                        09-May-2011 07:40  174K  
 libRNA_a-aln_util.o                                      09-May-2011 07:40   18K  
 libRNA_a-alipfold.o                                      09-May-2011 07:40  161K  
 libRNA_a-aliLfold.o                                      09-May-2011 07:40  103K  
 libRNA_a-alifold.o                                       09-May-2011 07:40  143K  
 libRNA_a-2Dpfold.o                                       09-May-2011 07:40  230K  
 libRNA_a-2Dfold.o                                        09-May-2011 07:40  275K  
 libRNA.a                                                 09-May-2011 07:40  4.3M  
 libg2.a                                                  09-May-2011 07:41  548K  
 Lfold.c                                                  04-Feb-2011 03:34   39K  
 inverse.c                                                26-Nov-2010 07:48   14K  
 intl22dH.h                                               26-Nov-2010 07:48  339K  
 intl22.h                                                 26-Nov-2010 07:48  339K  
 intl21dH.h                                               26-Nov-2010 07:48   66K  
 intl21.h                                                 26-Nov-2010 07:48   66K  
 intl11dH.h                                               26-Nov-2010 07:48   13K  
 intl11.h                                                 26-Nov-2010 07:48   13K  
 fold_vars.c                                              17-Mar-2011 05:43  2.2K  
 fold.c                                                   18-Apr-2011 05:12   89K  
 findpath.c                                               26-Nov-2010 07:48   12K  
 energy_par.c                                             26-Nov-2010 07:48   26K  
 duplex.c                                                 26-Nov-2010 07:48   17K  
 dist_vars.c                                              26-Nov-2010 07:48  309   
 convert_epars.c                                          26-Nov-2010 07:48   33K  
 cofold.c                                                 26-Nov-2010 07:48   43K  
 circfold.inc                                             26-Nov-2010 07:48  8.1K  
 aln_util.c                                               26-Nov-2010 07:48  4.5K  
 alipfold.c                                               26-Nov-2010 07:48   38K  
 aliLfold.c                                               04-May-2011 03:50   30K  
 alifold.c                                                26-Nov-2010 07:48   34K  
 alicircfold.inc                                          26-Nov-2010 07:48  5.3K  
 2Dpfold.c                                                04-May-2011 03:50  139K  
 2Dfold.c                                                 04-May-2011 03:50  153K  
 1.8.4_intloops.h                                         26-Nov-2010 07:48  481K  
 1.8.4_epars.h                                            26-Nov-2010 07:48   14K