/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5776/A77371/A77371.CBTEAANXX_2.bam 1 249250621 3499041 26163 2 243199373 3300200 36518 3 198022430 2567175 18082 4 191154276 2397284 47574 5 180915260 2324780 14878 6 171115067 2249289 13543 7 159138663 2142777 16202 8 146364022 1932235 13337 9 141213431 1691076 18109 10 135534747 2224376 40639 11 135006516 1866593 17944 12 133851895 1822543 11546 13 115169878 1190659 6998 14 107349540 1233812 7574 15 102531392 1253206 8280 16 90354753 1369311 11617 17 81195210 1326201 13387 18 78077248 1011170 9028 19 59128983 1017140 9963 20 63025520 947362 6294 21 48129895 538492 5262 22 51304566 604900 5029 X 155270560 1050517 10137 Y 59373566 422534 19167 MT 16569 940 13 GL000207.1 4262 68 0 GL000226.1 15008 70182 2382 GL000229.1 19913 986 42 GL000231.1 27386 1159 40 GL000210.1 27682 252 4 GL000239.1 33824 1627 71 GL000235.1 34474 1297 52 GL000201.1 36148 278 10 GL000247.1 36422 854 22 GL000245.1 36651 1117 36 GL000197.1 37175 336 8 GL000203.1 37498 443 24 GL000246.1 38154 369 8 GL000249.1 38502 329 2 GL000196.1 38914 349 4 GL000248.1 39786 367 6 GL000244.1 39929 536 15 GL000238.1 39939 295 3 GL000202.1 40103 423 6 GL000234.1 40531 2486 60 GL000232.1 40652 3053 118 GL000206.1 41001 323 10 GL000240.1 41933 805 12 GL000236.1 41934 536 22 GL000241.1 42152 2438 66 GL000243.1 43341 1641 71 GL000242.1 43523 336 11 GL000230.1 43691 964 22 GL000237.1 45867 2455 78 GL000233.1 45941 922 19 GL000204.1 81310 1039 13 GL000198.1 90085 4520 136 GL000208.1 92689 9120 464 GL000191.1 106433 1008 25 GL000227.1 128374 988 19 GL000228.1 129120 6234 1411 GL000214.1 137718 17904 397 GL000221.1 155397 4844 112 GL000209.1 159169 1331 15 GL000218.1 161147 4532 70 GL000220.1 161802 121555 1804 GL000213.1 164239 977 27 GL000211.1 166566 2609 41 GL000199.1 169874 85797 9587 GL000217.1 172149 3077 113 GL000216.1 172294 23563 3421 GL000215.1 172545 970 24 GL000205.1 174588 9368 102 GL000219.1 179198 6327 164 GL000224.1 179693 20648 440 GL000223.1 180455 1527 29 GL000195.1 182896 10004 115 GL000212.1 186858 7775 344 GL000222.1 186861 2801 351 GL000200.1 187035 1354 23 GL000193.1 189789 6295 136 GL000194.1 191469 6901 134 GL000225.1 211173 30373 4146 GL000192.1 547496 8301 122 * 0 0 3351122