/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5776/A77369/A77369.CBTEAANXX_2.bam 1 249250621 2930260 14878 2 243199373 2726868 25030 3 198022430 2080482 7444 4 191154276 1986996 31372 5 180915260 1943588 5494 6 171115067 1811194 4737 7 159138663 1843405 9094 8 146364022 1652000 6528 9 141213431 1462665 12786 10 135534747 1891995 33666 11 135006516 1636683 12075 12 133851895 1520370 4571 13 115169878 999293 2296 14 107349540 1053899 3127 15 102531392 1068311 3991 16 90354753 1235139 7562 17 81195210 1155268 10121 18 78077248 898852 6517 19 59128983 966223 8068 20 63025520 850290 3131 21 48129895 486895 3258 22 51304566 575464 3280 X 155270560 898592 6282 Y 59373566 355487 16625 MT 16569 296 4 GL000207.1 4262 78 1 GL000226.1 15008 73163 2475 GL000229.1 19913 1078 37 GL000231.1 27386 1524 74 GL000210.1 27682 270 6 GL000239.1 33824 1741 94 GL000235.1 34474 1427 62 GL000201.1 36148 364 11 GL000247.1 36422 937 20 GL000245.1 36651 1155 32 GL000197.1 37175 335 13 GL000203.1 37498 472 21 GL000246.1 38154 289 5 GL000249.1 38502 309 5 GL000196.1 38914 205 8 GL000248.1 39786 343 5 GL000244.1 39929 471 13 GL000238.1 39939 247 1 GL000202.1 40103 556 9 GL000234.1 40531 2828 69 GL000232.1 40652 3635 98 GL000206.1 41001 298 5 GL000240.1 41933 970 26 GL000236.1 41934 548 18 GL000241.1 42152 2674 69 GL000243.1 43341 1807 131 GL000242.1 43523 420 14 GL000230.1 43691 1107 27 GL000237.1 45867 2879 104 GL000233.1 45941 1103 24 GL000204.1 81310 1307 8 GL000198.1 90085 5283 154 GL000208.1 92689 10113 398 GL000191.1 106433 823 20 GL000227.1 128374 955 18 GL000228.1 129120 7914 2364 GL000214.1 137718 21299 396 GL000221.1 155397 5175 121 GL000209.1 159169 1206 12 GL000218.1 161147 5156 77 GL000220.1 161802 141095 1907 GL000213.1 164239 994 24 GL000211.1 166566 2507 38 GL000199.1 169874 81783 10713 GL000217.1 172149 3069 101 GL000216.1 172294 24729 3912 GL000215.1 172545 1108 27 GL000205.1 174588 9841 76 GL000219.1 179198 7094 171 GL000224.1 179693 24556 468 GL000223.1 180455 1307 40 GL000195.1 182896 9050 65 GL000212.1 186858 7245 331 GL000222.1 186861 2857 439 GL000200.1 187035 983 19 GL000193.1 189789 7272 167 GL000194.1 191469 7786 133 GL000225.1 211173 42997 7155 GL000192.1 547496 7326 106 * 0 0 1735342