/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5776/A77368/A77368.CBTEAANXX_2.bam 1 249250621 1697086 8295 2 243199373 1594243 14428 3 198022430 1217291 4550 4 191154276 1161332 18559 5 180915260 1130802 3269 6 171115067 1056898 2801 7 159138663 1073686 5122 8 146364022 959171 3673 9 141213431 849662 7327 10 135534747 1108124 19062 11 135006516 948647 6756 12 133851895 883137 2532 13 115169878 586052 1323 14 107349540 610827 1780 15 102531392 619681 2273 16 90354753 727860 4305 17 81195210 669198 5555 18 78077248 523089 3649 19 59128983 562222 4438 20 63025520 490425 1793 21 48129895 282856 1942 22 51304566 333354 1728 X 155270560 530401 3635 Y 59373566 213396 9781 MT 16569 222 3 GL000207.1 4262 27 1 GL000226.1 15008 42138 1469 GL000229.1 19913 590 20 GL000231.1 27386 871 42 GL000210.1 27682 146 2 GL000239.1 33824 1082 41 GL000235.1 34474 801 29 GL000201.1 36148 165 4 GL000247.1 36422 571 14 GL000245.1 36651 703 29 GL000197.1 37175 222 4 GL000203.1 37498 247 15 GL000246.1 38154 183 2 GL000249.1 38502 172 3 GL000196.1 38914 127 0 GL000248.1 39786 207 2 GL000244.1 39929 291 12 GL000238.1 39939 149 0 GL000202.1 40103 296 1 GL000234.1 40531 1759 47 GL000232.1 40652 2175 53 GL000206.1 41001 148 1 GL000240.1 41933 575 5 GL000236.1 41934 319 12 GL000241.1 42152 1514 30 GL000243.1 43341 967 63 GL000242.1 43523 223 7 GL000230.1 43691 686 17 GL000237.1 45867 1594 53 GL000233.1 45941 671 19 GL000204.1 81310 690 5 GL000198.1 90085 3183 85 GL000208.1 92689 5456 233 GL000191.1 106433 472 4 GL000227.1 128374 546 12 GL000228.1 129120 4883 1440 GL000214.1 137718 12344 228 GL000221.1 155397 2907 64 GL000209.1 159169 675 8 GL000218.1 161147 2808 45 GL000220.1 161802 80424 1030 GL000213.1 164239 574 10 GL000211.1 166566 1472 26 GL000199.1 169874 46361 5889 GL000217.1 172149 1794 56 GL000216.1 172294 15086 2435 GL000215.1 172545 684 12 GL000205.1 174588 5742 40 GL000219.1 179198 3931 99 GL000224.1 179693 14104 255 GL000223.1 180455 787 18 GL000195.1 182896 5338 51 GL000212.1 186858 3887 176 GL000222.1 186861 1718 233 GL000200.1 187035 602 12 GL000193.1 189789 4299 87 GL000194.1 191469 4590 65 GL000225.1 211173 26764 4378 GL000192.1 547496 4073 51 * 0 0 1058662