/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5776/A77362/A77362.CBTEAANXX_2.bam 1 249250621 1809099 8230 2 243199373 1333704 8097 3 198022430 1031887 3473 4 191154276 763085 9029 5 180915260 869789 2884 6 171115067 923008 2792 7 159138663 876330 4391 8 146364022 731889 2688 9 141213431 801237 4844 10 135534747 877810 8534 11 135006516 907546 4220 12 133851895 860072 2671 13 115169878 391194 1152 14 107349540 561773 1865 15 102531392 625264 2393 16 90354753 782320 4392 17 81195210 954708 5132 18 78077248 344088 1974 19 59128983 840805 4348 20 63025520 555963 1988 21 48129895 242587 1232 22 51304566 469501 2317 X 155270560 358470 2178 Y 59373566 89635 4056 MT 16569 562 6 GL000207.1 4262 7 1 GL000226.1 15008 15157 451 GL000229.1 19913 263 4 GL000231.1 27386 325 11 GL000210.1 27682 153 9 GL000239.1 33824 414 17 GL000235.1 34474 347 14 GL000201.1 36148 259 10 GL000247.1 36422 199 7 GL000245.1 36651 332 7 GL000197.1 37175 134 1 GL000203.1 37498 91 5 GL000246.1 38154 165 3 GL000249.1 38502 140 2 GL000196.1 38914 123 3 GL000248.1 39786 133 3 GL000244.1 39929 143 2 GL000238.1 39939 82 2 GL000202.1 40103 272 2 GL000234.1 40531 582 15 GL000232.1 40652 765 23 GL000206.1 41001 355 13 GL000240.1 41933 168 8 GL000236.1 41934 110 5 GL000241.1 42152 557 11 GL000243.1 43341 367 26 GL000242.1 43523 131 9 GL000230.1 43691 150 2 GL000237.1 45867 571 17 GL000233.1 45941 89 2 GL000204.1 81310 773 8 GL000198.1 90085 1037 35 GL000208.1 92689 1327 77 GL000191.1 106433 675 19 GL000227.1 128374 360 4 GL000228.1 129120 2053 541 GL000214.1 137718 6861 109 GL000221.1 155397 1338 32 GL000209.1 159169 898 18 GL000218.1 161147 1381 20 GL000220.1 161802 77021 1314 GL000213.1 164239 175 4 GL000211.1 166566 591 11 GL000199.1 169874 11860 1682 GL000217.1 172149 677 20 GL000216.1 172294 5654 863 GL000215.1 172545 157 3 GL000205.1 174588 3635 25 GL000219.1 179198 1660 44 GL000224.1 179693 4140 85 GL000223.1 180455 511 17 GL000195.1 182896 4139 39 GL000212.1 186858 1907 100 GL000222.1 186861 764 129 GL000200.1 187035 397 11 GL000193.1 189789 1891 38 GL000194.1 191469 2425 41 GL000225.1 211173 10212 1710 GL000192.1 547496 2772 45 * 0 0 807728