/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5776/A77359/A77359.CBTEAANXX_2.bam 1 249250621 3362410 16003 2 243199373 2754023 21262 3 198022430 2011475 6785 4 191154276 1830014 33501 5 180915260 1921395 5398 6 171115067 1813125 4524 7 159138663 1897845 8561 8 146364022 1686965 5886 9 141213431 1604488 11266 10 135534747 1949016 27227 11 135006516 1764983 11497 12 133851895 1613648 4600 13 115169878 948187 2123 14 107349540 1130371 3176 15 102531392 1280086 4482 16 90354753 1494021 8185 17 81195210 1505078 12142 18 78077248 949500 7794 19 59128983 1290141 9071 20 63025520 1058691 3424 21 48129895 535376 3286 22 51304566 807667 3962 X 155270560 825542 5771 Y 59373566 374714 18776 MT 16569 484 6 GL000207.1 4262 83 1 GL000226.1 15008 86197 2691 GL000229.1 19913 1332 41 GL000231.1 27386 1681 59 GL000210.1 27682 398 2 GL000239.1 33824 1770 97 GL000235.1 34474 1689 72 GL000201.1 36148 472 17 GL000247.1 36422 1111 22 GL000245.1 36651 1283 29 GL000197.1 37175 456 13 GL000203.1 37498 435 21 GL000246.1 38154 228 5 GL000249.1 38502 471 12 GL000196.1 38914 184 5 GL000248.1 39786 512 9 GL000244.1 39929 737 19 GL000238.1 39939 316 5 GL000202.1 40103 801 9 GL000234.1 40531 2903 60 GL000232.1 40652 3644 78 GL000206.1 41001 405 12 GL000240.1 41933 1280 17 GL000236.1 41934 527 24 GL000241.1 42152 2394 76 GL000243.1 43341 2069 141 GL000242.1 43523 492 13 GL000230.1 43691 1208 40 GL000237.1 45867 2878 123 GL000233.1 45941 1285 27 GL000204.1 81310 2082 10 GL000198.1 90085 5808 131 GL000208.1 92689 4746 238 GL000191.1 106433 1207 25 GL000227.1 128374 1014 17 GL000228.1 129120 12902 3850 GL000214.1 137718 30552 531 GL000221.1 155397 5209 134 GL000209.1 159169 1216 12 GL000218.1 161147 5862 91 GL000220.1 161802 213046 2777 GL000213.1 164239 1158 20 GL000211.1 166566 2563 32 GL000199.1 169874 51309 8081 GL000217.1 172149 2647 96 GL000216.1 172294 33527 5327 GL000215.1 172545 1200 19 GL000205.1 174588 11791 83 GL000219.1 179198 5833 161 GL000224.1 179693 19146 441 GL000223.1 180455 1749 37 GL000195.1 182896 11371 110 GL000212.1 186858 6958 248 GL000222.1 186861 3100 514 GL000200.1 187035 799 22 GL000193.1 189789 10726 229 GL000194.1 191469 8867 123 GL000225.1 211173 69060 12029 GL000192.1 547496 8609 117 * 0 0 1980130