/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5776/A77358/A77358.CBTEAANXX_2.bam 1 249250621 1871274 8996 2 243199373 1537206 12250 3 198022430 1139163 3889 4 191154276 1031401 20673 5 180915260 1067269 3029 6 171115067 1002355 2586 7 159138663 1078039 4992 8 146364022 945552 3253 9 141213431 894036 6428 10 135534747 1107400 16267 11 135006516 991784 6313 12 133851895 904840 2506 13 115169878 531599 1229 14 107349540 640729 1804 15 102531392 711648 2490 16 90354753 862252 4699 17 81195210 841162 6596 18 78077248 531307 4548 19 59128983 738763 4997 20 63025520 592251 1901 21 48129895 303296 1926 22 51304566 458000 2220 X 155270560 475336 3247 Y 59373566 230071 11676 MT 16569 350 6 GL000207.1 4262 66 0 GL000226.1 15008 49488 1528 GL000229.1 19913 793 24 GL000231.1 27386 970 37 GL000210.1 27682 237 4 GL000239.1 33824 1047 45 GL000235.1 34474 892 47 GL000201.1 36148 272 8 GL000247.1 36422 700 20 GL000245.1 36651 720 16 GL000197.1 37175 235 3 GL000203.1 37498 257 15 GL000246.1 38154 135 3 GL000249.1 38502 275 6 GL000196.1 38914 127 0 GL000248.1 39786 329 8 GL000244.1 39929 482 10 GL000238.1 39939 189 2 GL000202.1 40103 486 7 GL000234.1 40531 1787 58 GL000232.1 40652 2119 50 GL000206.1 41001 255 3 GL000240.1 41933 773 17 GL000236.1 41934 275 10 GL000241.1 42152 1514 36 GL000243.1 43341 1253 83 GL000242.1 43523 265 7 GL000230.1 43691 650 29 GL000237.1 45867 1713 45 GL000233.1 45941 748 21 GL000204.1 81310 1132 10 GL000198.1 90085 3335 72 GL000208.1 92689 2594 162 GL000191.1 106433 597 11 GL000227.1 128374 605 17 GL000228.1 129120 7867 2478 GL000214.1 137718 17393 297 GL000221.1 155397 2907 72 GL000209.1 159169 653 7 GL000218.1 161147 3320 53 GL000220.1 161802 120480 1496 GL000213.1 164239 687 14 GL000211.1 166566 1552 20 GL000199.1 169874 30023 4537 GL000217.1 172149 1635 61 GL000216.1 172294 20292 3355 GL000215.1 172545 689 14 GL000205.1 174588 6747 55 GL000219.1 179198 3233 90 GL000224.1 179693 10962 279 GL000223.1 180455 946 26 GL000195.1 182896 6241 63 GL000212.1 186858 3858 143 GL000222.1 186861 1705 262 GL000200.1 187035 487 10 GL000193.1 189789 6418 133 GL000194.1 191469 5147 90 GL000225.1 211173 41534 7269 GL000192.1 547496 4489 72 * 0 0 1134168