/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5776/A77248/A77248.CBTEAANXX_2.bam 1 249250621 1493704 8530 2 243199373 1342794 13417 3 198022430 1018595 3935 4 191154276 913305 12813 5 180915260 940906 3210 6 171115067 880183 2759 7 159138663 907959 4920 8 146364022 809818 3671 9 141213431 726602 6388 10 135534747 922135 15823 11 135006516 818793 7525 12 133851895 754544 2614 13 115169878 472127 1247 14 107349540 521100 1793 15 102531392 547377 2304 16 90354753 699935 5638 17 81195210 603956 5402 18 78077248 435487 3157 19 59128983 501088 4102 20 63025520 438339 1671 21 48129895 230003 1535 22 51304566 296061 1343 X 155270560 840507 4546 Y 59373566 23579 3770 MT 16569 33 1 GL000207.1 4262 40 1 GL000226.1 15008 45652 1646 GL000229.1 19913 454 16 GL000231.1 27386 737 29 GL000210.1 27682 131 2 GL000239.1 33824 708 36 GL000235.1 34474 626 41 GL000201.1 36148 140 6 GL000247.1 36422 415 11 GL000245.1 36651 514 13 GL000197.1 37175 134 2 GL000203.1 37498 173 7 GL000246.1 38154 109 6 GL000249.1 38502 158 4 GL000196.1 38914 107 3 GL000248.1 39786 177 5 GL000244.1 39929 235 3 GL000238.1 39939 127 3 GL000202.1 40103 242 2 GL000234.1 40531 1239 30 GL000232.1 40652 1816 45 GL000206.1 41001 132 6 GL000240.1 41933 517 13 GL000236.1 41934 217 7 GL000241.1 42152 1061 34 GL000243.1 43341 709 41 GL000242.1 43523 220 7 GL000230.1 43691 382 21 GL000237.1 45867 1103 49 GL000233.1 45941 392 15 GL000204.1 81310 691 7 GL000198.1 90085 2185 67 GL000208.1 92689 4380 195 GL000191.1 106433 459 10 GL000227.1 128374 399 11 GL000228.1 129120 3452 1009 GL000214.1 137718 10142 201 GL000221.1 155397 2370 64 GL000209.1 159169 331 5 GL000218.1 161147 2352 43 GL000220.1 161802 61503 912 GL000213.1 164239 455 8 GL000211.1 166566 1227 9 GL000199.1 169874 36113 5288 GL000217.1 172149 1396 45 GL000216.1 172294 10235 1683 GL000215.1 172545 555 13 GL000205.1 174588 4652 43 GL000219.1 179198 3340 85 GL000224.1 179693 11711 231 GL000223.1 180455 662 18 GL000195.1 182896 4628 45 GL000212.1 186858 1668 33 GL000222.1 186861 1318 179 GL000200.1 187035 396 14 GL000193.1 189789 3004 65 GL000194.1 191469 3300 45 GL000225.1 211173 17786 3193 GL000192.1 547496 3627 53 * 0 0 942158