/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5776/A77247/A77247.CBTEAANXX_2.bam 1 249250621 1497406 8590 2 243199373 1497724 13093 3 198022430 1189798 4692 4 191154276 1117988 9806 5 180915260 1080218 4005 6 171115067 1016921 3390 7 159138663 958380 5312 8 146364022 892897 4116 9 141213431 741905 6776 10 135534747 930985 14753 11 135006516 831954 7253 12 133851895 796594 3076 13 115169878 568662 1740 14 107349540 547327 2111 15 102531392 531171 2497 16 90354753 604382 5235 17 81195210 508594 4980 18 78077248 470201 3065 19 59128983 368110 3905 20 63025520 387605 1750 21 48129895 232327 1527 22 51304566 222833 1301 X 155270560 921526 4883 Y 59373566 18431 2494 MT 16569 27 1 GL000207.1 4262 24 2 GL000226.1 15008 42490 1441 GL000229.1 19913 377 15 GL000231.1 27386 607 32 GL000210.1 27682 74 1 GL000239.1 33824 647 37 GL000235.1 34474 679 17 GL000201.1 36148 81 3 GL000247.1 36422 315 19 GL000245.1 36651 626 15 GL000197.1 37175 97 3 GL000203.1 37498 276 18 GL000246.1 38154 127 3 GL000249.1 38502 127 3 GL000196.1 38914 126 2 GL000248.1 39786 137 4 GL000244.1 39929 198 2 GL000238.1 39939 93 1 GL000202.1 40103 130 0 GL000234.1 40531 1101 34 GL000232.1 40652 1441 50 GL000206.1 41001 101 3 GL000240.1 41933 368 14 GL000236.1 41934 206 15 GL000241.1 42152 1346 39 GL000243.1 43341 529 37 GL000242.1 43523 143 5 GL000230.1 43691 373 13 GL000237.1 45867 937 42 GL000233.1 45941 405 9 GL000204.1 81310 378 2 GL000198.1 90085 2059 65 GL000208.1 92689 3762 172 GL000191.1 106433 369 14 GL000227.1 128374 449 15 GL000228.1 129120 2406 690 GL000214.1 137718 7782 143 GL000221.1 155397 2498 66 GL000209.1 159169 304 5 GL000218.1 161147 2208 46 GL000220.1 161802 34508 510 GL000213.1 164239 449 12 GL000211.1 166566 1262 20 GL000199.1 169874 37511 5637 GL000217.1 172149 1617 54 GL000216.1 172294 7045 1139 GL000215.1 172545 454 15 GL000205.1 174588 4265 29 GL000219.1 179198 3411 79 GL000224.1 179693 8749 166 GL000223.1 180455 506 15 GL000195.1 182896 4324 39 GL000212.1 186858 1612 36 GL000222.1 186861 1187 180 GL000200.1 187035 409 15 GL000193.1 189789 2489 36 GL000194.1 191469 3116 60 GL000225.1 211173 12328 2071 GL000192.1 547496 3347 46 * 0 0 776928