/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5763/A77346/A77346.CBKY8ANXX_5.bam 1 249250621 2444977 19762 2 243199373 2291651 26804 3 198022430 1774072 14136 4 191154276 1611911 29501 5 180915260 1590379 11047 6 171115067 1572527 10519 7 159138663 1520186 12742 8 146364022 1340565 10223 9 141213431 1171108 13370 10 135534747 1606572 32896 11 135006516 1309674 13793 12 133851895 1265192 8537 13 115169878 804103 5148 14 107349540 857379 5794 15 102531392 873495 6516 16 90354753 1038781 10169 17 81195210 967211 10582 18 78077248 686324 6504 19 59128983 760921 7738 20 63025520 669735 4739 21 48129895 374271 3567 22 51304566 452606 4056 X 155270560 711091 7324 Y 59373566 295873 12819 MT 16569 568 2 GL000207.1 4262 52 1 GL000226.1 15008 45799 1567 GL000229.1 19913 702 30 GL000231.1 27386 858 29 GL000210.1 27682 234 0 GL000239.1 33824 1055 66 GL000235.1 34474 1065 41 GL000201.1 36148 228 5 GL000247.1 36422 718 19 GL000245.1 36651 675 17 GL000197.1 37175 293 11 GL000203.1 37498 266 13 GL000246.1 38154 187 7 GL000249.1 38502 249 7 GL000196.1 38914 219 2 GL000248.1 39786 255 5 GL000244.1 39929 359 11 GL000238.1 39939 146 1 GL000202.1 40103 422 9 GL000234.1 40531 1669 34 GL000232.1 40652 1868 62 GL000206.1 41001 214 5 GL000240.1 41933 799 16 GL000236.1 41934 331 5 GL000241.1 42152 1456 40 GL000243.1 43341 1237 59 GL000242.1 43523 255 8 GL000230.1 43691 691 31 GL000237.1 45867 1862 54 GL000233.1 45941 642 20 GL000204.1 81310 767 3 GL000198.1 90085 2554 78 GL000208.1 92689 5802 359 GL000191.1 106433 641 10 GL000227.1 128374 686 15 GL000228.1 129120 4843 1072 GL000214.1 137718 8152 184 GL000221.1 155397 3362 84 GL000209.1 159169 1280 17 GL000218.1 161147 2813 58 GL000220.1 161802 90614 1418 GL000213.1 164239 868 18 GL000211.1 166566 1855 25 GL000199.1 169874 49150 6917 GL000217.1 172149 2078 82 GL000216.1 172294 14259 2055 GL000215.1 172545 740 18 GL000205.1 174588 5853 77 GL000219.1 179198 5622 108 GL000224.1 179693 12898 236 GL000223.1 180455 893 17 GL000195.1 182896 6965 57 GL000212.1 186858 5188 222 GL000222.1 186861 1852 237 GL000200.1 187035 780 20 GL000193.1 189789 5123 125 GL000194.1 191469 4178 78 GL000225.1 211173 24042 2923 GL000192.1 547496 5151 87 * 0 0 2148434