/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5763/A77338/A77338.CBKY8ANXX_5.bam 1 249250621 1704848 11953 2 243199373 1527252 17926 3 198022430 1129907 6224 4 191154276 1078144 29341 5 180915260 1059508 5113 6 171115067 1025204 4507 7 159138663 1072979 7279 8 146364022 892257 5151 9 141213431 846093 8453 10 135534747 1014621 17427 11 135006516 904184 8002 12 133851895 870063 4117 13 115169878 550823 2366 14 107349540 608926 2930 15 102531392 625448 4133 16 90354753 729869 6121 17 81195210 732149 7484 18 78077248 459873 4401 19 59128983 739719 5841 20 63025520 492259 2719 21 48129895 288711 2786 22 51304566 342823 2872 X 155270560 459951 4217 Y 59373566 213784 12777 MT 16569 356 5 GL000207.1 4262 41 1 GL000226.1 15008 28143 1257 GL000229.1 19913 1164 41 GL000231.1 27386 1207 67 GL000210.1 27682 122 4 GL000239.1 33824 1463 84 GL000235.1 34474 934 56 GL000201.1 36148 186 12 GL000247.1 36422 799 32 GL000245.1 36651 535 18 GL000197.1 37175 281 10 GL000203.1 37498 177 7 GL000246.1 38154 176 4 GL000249.1 38502 126 5 GL000196.1 38914 167 5 GL000248.1 39786 129 1 GL000244.1 39929 403 12 GL000238.1 39939 151 3 GL000202.1 40103 277 3 GL000234.1 40531 2048 51 GL000232.1 40652 1907 54 GL000206.1 41001 170 8 GL000240.1 41933 771 13 GL000236.1 41934 255 10 GL000241.1 42152 1486 36 GL000243.1 43341 1476 92 GL000242.1 43523 131 9 GL000230.1 43691 492 17 GL000237.1 45867 2883 115 GL000233.1 45941 490 12 GL000204.1 81310 839 7 GL000198.1 90085 2377 76 GL000208.1 92689 2687 186 GL000191.1 106433 479 10 GL000227.1 128374 541 13 GL000228.1 129120 8796 1864 GL000214.1 137718 19275 420 GL000221.1 155397 3046 81 GL000209.1 159169 294 6 GL000218.1 161147 3930 56 GL000220.1 161802 350959 6816 GL000213.1 164239 655 18 GL000211.1 166566 1383 29 GL000199.1 169874 30928 4090 GL000217.1 172149 1776 77 GL000216.1 172294 17619 2968 GL000215.1 172545 645 12 GL000205.1 174588 6202 69 GL000219.1 179198 3776 93 GL000224.1 179693 15738 374 GL000223.1 180455 1803 52 GL000195.1 182896 6335 62 GL000212.1 186858 5866 270 GL000222.1 186861 2130 409 GL000200.1 187035 440 9 GL000193.1 189789 8250 357 GL000194.1 191469 5477 125 GL000225.1 211173 35383 4863 GL000192.1 547496 3338 66 * 0 0 1677344