/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5762/A77313/A77313.CBKY8ANXX_4.bam 1 249250621 1244103 9155 2 243199373 1038791 13679 3 198022430 769051 4423 4 191154276 700803 19709 5 180915260 734005 3533 6 171115067 658457 3034 7 159138663 785641 5325 8 146364022 635967 3745 9 141213431 617945 6585 10 135534747 804463 16427 11 135006516 674116 7762 12 133851895 614353 2972 13 115169878 367146 1554 14 107349540 445373 2079 15 102531392 475670 2682 16 90354753 645387 5208 17 81195210 558559 5552 18 78077248 355610 3827 19 59128983 532804 4547 20 63025520 400261 2237 21 48129895 219781 1964 22 51304566 295691 1590 X 155270560 626661 4364 Y 59373566 32607 5650 MT 16569 148 2 GL000207.1 4262 21 1 GL000226.1 15008 44816 1359 GL000229.1 19913 633 26 GL000231.1 27386 950 44 GL000210.1 27682 153 4 GL000239.1 33824 946 52 GL000235.1 34474 901 35 GL000201.1 36148 197 5 GL000247.1 36422 587 17 GL000245.1 36651 551 15 GL000197.1 37175 165 2 GL000203.1 37498 238 12 GL000246.1 38154 123 3 GL000249.1 38502 145 1 GL000196.1 38914 74 2 GL000248.1 39786 184 2 GL000244.1 39929 345 5 GL000238.1 39939 141 2 GL000202.1 40103 334 4 GL000234.1 40531 1576 36 GL000232.1 40652 1959 47 GL000206.1 41001 114 1 GL000240.1 41933 721 16 GL000236.1 41934 210 5 GL000241.1 42152 1461 33 GL000243.1 43341 1204 52 GL000242.1 43523 141 3 GL000230.1 43691 758 9 GL000237.1 45867 1407 50 GL000233.1 45941 811 18 GL000204.1 81310 670 3 GL000198.1 90085 2565 74 GL000208.1 92689 4394 172 GL000191.1 106433 369 11 GL000227.1 128374 346 5 GL000228.1 129120 4975 1517 GL000214.1 137718 18547 294 GL000221.1 155397 3027 63 GL000209.1 159169 312 4 GL000218.1 161147 4274 50 GL000220.1 161802 118883 1446 GL000213.1 164239 546 9 GL000211.1 166566 1176 18 GL000199.1 169874 38484 4295 GL000217.1 172149 1562 56 GL000216.1 172294 16149 2510 GL000215.1 172545 485 11 GL000205.1 174588 4991 38 GL000219.1 179198 3603 82 GL000224.1 179693 16727 239 GL000223.1 180455 732 14 GL000195.1 182896 4103 35 GL000212.1 186858 2130 39 GL000222.1 186861 1449 263 GL000200.1 187035 358 10 GL000193.1 189789 6151 150 GL000194.1 191469 3170 81 GL000225.1 211173 31821 4987 GL000192.1 547496 2855 39 * 0 0 876054